Médico cirujano de la Universidad de Chile, con especialidad en Medicina Interna y Nefrología. Desde el año 1995 ocupó el cargo de director médico de la Clínica Las Condes, hasta el 2010 cuando asumió como Ministro de Salud, cargo que mantuvo durante todo el período presidencial. Finalizado el gobierno, el Dr. Mañalich se desempeñó como Director del Instituto de Políticas Públicas en Salud de la Universidad San Sebastián y posteriormente, como Jefe del Departamento de Salud Pública y Epidemiología de la Universidad de Los Andes.

En 2017 asumió como gerente general de la Clínica Las Condes y en marzo de 2018 ingresó al Directorio de la Fundación Teletón. En junio del 2019 fue designado nuevamente como Ministro de Salud.